梅迪奇小礼拜堂分为三个不同的区域。门廊的不远处是一个低拱状的地窖，一块适宜的空间被黄铜质地的围栏环绕其中，里面是梅迪奇家族次等一级成员的墓地。从这里有台阶延伸到八角形的王室教堂，这个巨大的家族陵墓从科西莫一世在1604年开始兴建。教堂的屋顶都是华丽的壁画，墙上镶嵌着无数闪耀夺目的宝石。墙边时梅迪奇家族六位大公的墓地。一个走廊延伸到米开朗基罗的新圣器收藏室，是相对于在圣洛伦佐布鲁内勒斯基的旧圣器收藏室设计而言的。三组雕塑都是由米开朗基罗在1520到1534年之间雕刻完成的，矗立在墙的周围：近左手墙边是乌尔比罗大公的陵墓（伟大的洛伦佐的孙子）。对面是内穆尔大公的陵墓（伟大的洛伦佐的第三个儿子）。紧靠着未完成的《圣母玛丽娅和耶稣》是洛伦佐的和他被谋杀的兄弟朱利安尼（死于1478年）的陵墓。