这座博物馆原本是一个大教堂，在经过大规模的改造之后，现在成为了一座有着许多展示厅的博物馆，不过博物馆里的不少房间仍然用来展示这座大教堂的历史。一楼大厅的主要部分被用来摆放阿诺芙－迪－坎比奥的雕像，这些雕像以前只是被摆放在教堂的一个小角落里；临近的是多那太罗的《圣约翰》。一个新的展示厅被用来搁放十四到十五世纪的油画作品和遗物箱。而米开朗基罗的《圣殇》则被挂在楼梯的显眼地方。另外，尼苛德莫所画的带头巾的画像被普遍认为这是他自己的自画像。在楼上的第一个展厅里有二个关于唱诗班的作品，它们的历史可以追溯到1430年，分别由路加－德拉－罗比亚和多那太罗所作。他们都是由易脆的大理石雕刻而成，上面加以彩色玻璃和马赛克装饰，表现的是唱诗班的儿童用乐器表演和跳舞时的场景。在这个展厅里还有多那太罗的其他物品，比如《马达莱纳雕像》（1455）和一些遗物。左边的展厅则展出的是当初用来装饰钟楼的一些牌匾。底层的展厅则展示的有伯鲁乃列斯基的工匠们所用的一些工具，还有一个以前的迪－坎比奥教堂的外观复制品。